MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Nocardia brasiliensis ATCC 700358 chromosome

Total Repeats: 222722

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018681	GAC	2	6	4	9	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
2	NC_018681	CCG	2	6	85	90	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
3	NC_018681	CAG	2	6	103	108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
4	NC_018681	CGC	2	6	276	281	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
5	NC_018681	GCC	2	6	295	300	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
6	NC_018681	CG	3	6	304	309	0 %	0 %	50 %	50 %	407641179
7	NC_018681	GCA	2	6	311	316	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
8	NC_018681	CGA	2	6	471	476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
9	NC_018681	GCG	2	6	530	535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641179
10	NC_018681	CCGC	2	8	571	578	0 %	0 %	25 %	75 %	407641179
11	NC_018681	CCGG	2	8	591	598	0 %	0 %	50 %	50 %	407641179
12	NC_018681	GAC	2	6	628	633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
13	NC_018681	GCC	2	6	654	659	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
14	NC_018681	GCG	2	6	660	665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641179
15	NC_018681	CGCC	2	8	674	681	0 %	0 %	25 %	75 %	407641179
16	NC_018681	CCG	2	6	684	689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
17	NC_018681	GCC	2	6	702	707	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
18	NC_018681	GCG	2	6	708	713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641179
19	NC_018681	CCCG	2	8	723	730	0 %	0 %	25 %	75 %	407641179
20	NC_018681	GC	4	8	786	793	0 %	0 %	50 %	50 %	407641179
21	NC_018681	GGC	2	6	804	809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641179
22	NC_018681	GGC	2	6	831	836	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641179
23	NC_018681	ACG	3	9	881	889	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
24	NC_018681	GGT	2	6	894	899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641179
25	NC_018681	TCG	2	6	964	969	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641179
26	NC_018681	CGC	3	9	1035	1043	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
27	NC_018681	CGG	2	6	1133	1138	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641179
28	NC_018681	TCA	2	6	1211	1216	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407641179
29	NC_018681	CGA	2	6	1227	1232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
30	NC_018681	CTG	2	6	1276	1281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641179
31	NC_018681	CGA	2	6	1284	1289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
32	NC_018681	AAGG	2	8	1309	1316	50 %	0 %	50 %	0 %	407641179
33	NC_018681	AGG	2	6	1322	1327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407641179
34	NC_018681	TTC	2	6	1330	1335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407641179
35	NC_018681	CAA	2	6	1362	1367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407641179
36	NC_018681	TCG	2	6	1373	1378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641179
37	NC_018681	TCC	2	6	1381	1386	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407641179
38	NC_018681	CCGC	2	8	1389	1396	0 %	0 %	25 %	75 %	407641179
39	NC_018681	AGC	2	6	1400	1405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641179
40	NC_018681	GCC	2	6	1467	1472	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
41	NC_018681	AAG	2	6	1504	1509	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407641179
42	NC_018681	GC	3	6	1595	1600	0 %	0 %	50 %	50 %	407641179
43	NC_018681	GGT	2	6	1662	1667	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641179
44	NC_018681	CCG	2	6	1733	1738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641179
45	NC_018681	GAG	2	6	1759	1764	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407641179
46	NC_018681	GC	3	6	1801	1806	0 %	0 %	50 %	50 %	407641179
47	NC_018681	GACC	2	8	1836	1843	25 %	0 %	25 %	50 %	407641179
48	NC_018681	ACCAC	2	10	1880	1889	40 %	0 %	0 %	60 %	407641179
49	NC_018681	GAA	2	6	1905	1910	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407641179
50	NC_018681	GCG	2	6	1932	1937	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641179
51	NC_018681	CG	3	6	1968	1973	0 %	0 %	50 %	50 %	407641179
52	NC_018681	AAC	2	6	1979	1984	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407641179
53	NC_018681	TCCCG	2	10	3027	3036	0 %	20 %	20 %	60 %	407641180
54	NC_018681	TCCCG	2	10	3040	3049	0 %	20 %	20 %	60 %	407641180
55	NC_018681	CGG	2	6	3055	3060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641180
56	NC_018681	TCG	2	6	3069	3074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641180
57	NC_018681	CGA	2	6	3076	3081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641180
58	NC_018681	CCGG	2	8	3174	3181	0 %	0 %	50 %	50 %	407641180
59	NC_018681	GCA	2	6	3328	3333	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641180
60	NC_018681	GTCGCC	2	12	3380	3391	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	407641180
61	NC_018681	CGA	2	6	3400	3405	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641180
62	NC_018681	GGT	2	6	3454	3459	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641180
63	NC_018681	ACCG	2	8	3470	3477	25 %	0 %	25 %	50 %	407641180
64	NC_018681	GCC	2	6	3569	3574	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641180
65	NC_018681	GCT	2	6	3640	3645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641180
66	NC_018681	CGC	2	6	3665	3670	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641180
67	NC_018681	ACC	3	9	3671	3679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407641180
68	NC_018681	GCT	2	6	3715	3720	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641180
69	NC_018681	AC	3	6	3730	3735	50 %	0 %	0 %	50 %	407641180
70	NC_018681	GC	3	6	3807	3812	0 %	0 %	50 %	50 %	407641180
71	NC_018681	CCG	2	6	3852	3857	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641180
72	NC_018681	GTG	2	6	3858	3863	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641180
73	NC_018681	ACG	2	6	3864	3869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641180
74	NC_018681	CAC	2	6	3994	3999	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407641180
75	NC_018681	TGC	3	9	4017	4025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641180
76	NC_018681	GAG	3	9	4034	4042	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407641180
77	NC_018681	GTTC	2	8	4408	4415	0 %	50 %	25 %	25 %	407641181
78	NC_018681	CAT	2	6	4448	4453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407641181
79	NC_018681	AACGGC	2	12	4499	4510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641181
80	NC_018681	CGC	2	6	4567	4572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641181
81	NC_018681	CGC	2	6	4578	4583	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641181
82	NC_018681	CGT	2	6	4624	4629	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641181
83	NC_018681	CCGG	2	8	4635	4642	0 %	0 %	50 %	50 %	407641181
84	NC_018681	CG	3	6	4685	4690	0 %	0 %	50 %	50 %	407641181
85	NC_018681	GCG	2	6	4711	4716	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641181
86	NC_018681	CGC	2	6	4799	4804	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641181
87	NC_018681	CAC	2	6	4825	4830	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407641181
88	NC_018681	TGC	2	6	4875	4880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641181
89	NC_018681	GCT	2	6	4894	4899	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641181
90	NC_018681	GGC	2	6	4911	4916	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641181
91	NC_018681	TG	3	6	4951	4956	0 %	50 %	50 %	0 %	407641181
92	NC_018681	CCAC	2	8	4971	4978	25 %	0 %	0 %	75 %	407641181
93	NC_018681	TGC	2	6	4986	4991	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641181
94	NC_018681	CGT	2	6	5040	5045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641181
95	NC_018681	GCC	2	6	5104	5109	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641181
96	NC_018681	CGA	2	6	5143	5148	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641181
97	NC_018681	TGC	2	6	5172	5177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641181
98	NC_018681	GTG	2	6	5214	5219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641181
99	NC_018681	TG	3	6	5218	5223	0 %	50 %	50 %	0 %	407641181
100	NC_018681	GGTC	2	8	5227	5234	0 %	25 %	50 %	25 %	407641181
101	NC_018681	CGA	2	6	5242	5247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641181
102	NC_018681	GC	3	6	5268	5273	0 %	0 %	50 %	50 %	407641181
103	NC_018681	GCCA	2	8	5288	5295	25 %	0 %	25 %	50 %	407641181
104	NC_018681	CGC	2	6	5332	5337	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641181
105	NC_018681	GC	3	6	5350	5355	0 %	0 %	50 %	50 %	407641181
106	NC_018681	TGC	3	9	5373	5381	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641181
107	NC_018681	CGA	2	6	5383	5388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641181
108	NC_018681	CGG	3	9	5408	5416	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641181
109	NC_018681	CGC	2	6	5428	5433	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641181
110	NC_018681	CGGC	2	8	5439	5446	0 %	0 %	50 %	50 %	407641181
111	NC_018681	GGA	2	6	5479	5484	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407641181
112	NC_018681	TGCC	2	8	5487	5494	0 %	25 %	25 %	50 %	407641181
113	NC_018681	CGC	2	6	5500	5505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641181
114	NC_018681	GACG	2	8	5524	5531	25 %	0 %	50 %	25 %	407641181
115	NC_018681	CAG	2	6	5801	5806	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641182
116	NC_018681	GC	3	6	5866	5871	0 %	0 %	50 %	50 %	407641182
117	NC_018681	GAG	2	6	5876	5881	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407641182
118	NC_018681	CG	3	6	5885	5890	0 %	0 %	50 %	50 %	407641182
119	NC_018681	CGC	2	6	5934	5939	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641182
120	NC_018681	GCC	2	6	5943	5948	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641182
121	NC_018681	GGT	2	6	6103	6108	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641182
122	NC_018681	CGC	2	6	6121	6126	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641182
123	NC_018681	CACGC	2	10	6128	6137	20 %	0 %	20 %	60 %	407641182
124	NC_018681	CGC	2	6	6169	6174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641182
125	NC_018681	GTG	2	6	6257	6262	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641182
126	NC_018681	CG	3	6	6336	6341	0 %	0 %	50 %	50 %	407641182
127	NC_018681	CAC	2	6	7048	7053	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407641183
128	NC_018681	CGA	2	6	7083	7088	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641183
129	NC_018681	GGC	2	6	7138	7143	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641183
130	NC_018681	GGT	2	6	7149	7154	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641183
131	NC_018681	CGA	2	6	7155	7160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641183
132	NC_018681	CGG	2	6	7236	7241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641183
133	NC_018681	GGT	2	6	7273	7278	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641183
134	NC_018681	GTG	2	6	7300	7305	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641183
135	NC_018681	TCC	2	6	7315	7320	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407641183
136	NC_018681	CAC	2	6	7425	7430	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407641183
137	NC_018681	CG	3	6	7491	7496	0 %	0 %	50 %	50 %	407641183
138	NC_018681	CGA	2	6	7548	7553	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641183
139	NC_018681	CGA	2	6	7578	7583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641183
140	NC_018681	GGA	2	6	7692	7697	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407641183
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142	NC_018681	CGT	2	6	7743	7748	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641183
143	NC_018681	GCAC	2	8	7862	7869	25 %	0 %	25 %	50 %	407641183
144	NC_018681	GAG	2	6	7870	7875	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407641183
145	NC_018681	CG	3	6	7882	7887	0 %	0 %	50 %	50 %	407641183
146	NC_018681	GGT	2	6	7899	7904	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641183
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148	NC_018681	AAG	2	6	7924	7929	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407641183
149	NC_018681	GAC	2	6	7963	7968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641183
150	NC_018681	AGACCA	2	12	8030	8041	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	407641183
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152	NC_018681	TCC	2	6	8155	8160	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	407641183
153	NC_018681	CGC	2	6	8175	8180	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641183
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155	NC_018681	TCG	2	6	8291	8296	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641183
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157	NC_018681	ATC	2	6	8374	8379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407641183
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159	NC_018681	ATC	2	6	8434	8439	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407641183
160	NC_018681	ACG	2	6	8462	8467	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641183
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162	NC_018681	GCT	3	9	8547	8555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641183
163	NC_018681	GCT	2	6	8559	8564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641183
164	NC_018681	GCC	2	6	8616	8621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641183
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166	NC_018681	CGG	2	6	8708	8713	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641183
167	NC_018681	AAG	2	6	8716	8721	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	407641183
168	NC_018681	CAA	2	6	8724	8729	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	407641183
169	NC_018681	GAC	2	6	8731	8736	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641183
170	NC_018681	ACC	2	6	8791	8796	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	407641183
171	NC_018681	GAC	2	6	8836	8841	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641183
172	NC_018681	GCGGCC	2	12	8842	8853	0 %	0 %	50 %	50 %	407641183
173	NC_018681	CGC	2	6	8896	8901	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641183
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241	NC_018681	TGCTC	2	10	11013	11022	0 %	40 %	20 %	40 %	407641184
242	NC_018681	CGA	3	9	11026	11034	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641184
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245	NC_018681	GGGCC	2	10	11104	11113	0 %	0 %	60 %	40 %	407641184
246	NC_018681	GTG	2	6	11171	11176	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641184
247	NC_018681	ATAC	2	8	11184	11191	50 %	25 %	0 %	25 %	407641184
248	NC_018681	CTG	2	6	11192	11197	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641184
249	NC_018681	CCG	2	6	11205	11210	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641184
250	NC_018681	GAG	2	6	11237	11242	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	407641184
251	NC_018681	CGG	2	6	11260	11265	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641184
252	NC_018681	TCG	2	6	11325	11330	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	407641184
253	NC_018681	GGT	3	9	11363	11371	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	407641184
254	NC_018681	GAC	2	6	11409	11414	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641184
255	NC_018681	TGA	2	6	11433	11438	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	407641184
256	NC_018681	TTGC	2	8	11459	11466	0 %	50 %	25 %	25 %	407641184
257	NC_018681	CG	3	6	11470	11475	0 %	0 %	50 %	50 %	407641184
258	NC_018681	CGA	2	6	11482	11487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641184
259	NC_018681	CCCGAT	2	12	11489	11500	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	407641184
260	NC_018681	CGG	2	6	11509	11514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641184
261	NC_018681	TTC	2	6	11530	11535	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	407641184
262	NC_018681	CCG	2	6	11660	11665	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641185
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382	NC_018681	GCC	2	6	17524	17529	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641191
383	NC_018681	CGC	2	6	17628	17633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	407641191
384	NC_018681	CGA	2	6	18092	18097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	407641192
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387	NC_018681	CGG	2	6	18141	18146	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641192
388	NC_018681	GGCT	2	8	18207	18214	0 %	25 %	50 %	25 %	407641192
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497	NC_018681	CGG	2	6	23683	23688	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	407641198
498	NC_018681	TGATCC	2	12	23764	23775	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407641198
499	NC_018681	CTGATC	2	12	23802	23813	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	407641198
500	NC_018681	TCA	2	6	23827	23832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	407641198

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